Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYFIP2Q96F07 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYFIP2Q96F07 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYFIP2Q96F07 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYFIP2Q96F07 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYFIP2Q96F07 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYFIP2Q96F07 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYFIP2Q96F07 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYFIP2Q96F07 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYFIP2Q96F07 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CYFIP2Q96F07 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CYFIP2Q96F07 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CYFIP2Q96F07 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms