Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEIL2Q969S2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEIL2Q969S2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEIL2Q969S2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms