Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NEO1Q92859 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEO1Q92859 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
NEO1Q92859 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NEO1Q92859 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NEO1Q92859 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NEO1Q92859 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NEO1Q92859 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NEO1Q92859 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NEO1Q92859 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NEO1Q92859 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
NEO1Q92859 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NEO1Q92859 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NEO1Q92859 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NEO1Q92859 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NEO1Q92859 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
NEO1Q92859 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NEO1Q92859 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms