Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX19Q92543 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX19Q92543 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX19Q92543 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX19Q92543 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms