Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SNX19Q92543 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SNX19Q92543 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SNX19Q92543 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SNX19Q92543 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SNX19Q92543 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SNX19Q92543 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SNX19Q92543 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SNX19Q92543 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SNX19Q92543 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SNX19Q92543 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SNX19Q92543 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SNX19Q92543 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SNX19Q92543 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SNX19Q92543 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SNX19Q92543 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SNX19Q92543 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SNX19Q92543 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SNX19Q92543 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SNX19Q92543 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SNX19Q92543 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SNX19Q92543 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SNX19Q92543 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SNX19Q92543 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SNX19Q92543 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SNX19Q92543 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SNX19Q92543 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SNX19Q92543 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SNX19Q92543 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SNX19Q92543 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SNX19Q92543 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SNX19Q92543 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SNX19Q92543 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SNX19Q92543 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SNX19Q92543 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNX19Q92543 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNX19Q92543 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SNX19Q92543 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SNX19Q92543 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SNX19Q92543 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SNX19Q92543 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
SNX19Q92543 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
SNX19Q92543 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNX19Q92543 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNX19Q92543 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SNX19Q92543 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SNX19Q92543 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNX19Q92543 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SNX19Q92543 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SNX19Q92543 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNX19Q92543 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNX19Q92543 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNX19Q92543 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNX19Q92543 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNX19Q92543 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SNX19Q92543 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SNX19Q92543 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SNX19Q92543 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNX19Q92543 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNX19Q92543 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SNX19Q92543 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNX19Q92543 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNX19Q92543 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNX19Q92543 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNX19Q92543 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNX19Q92543 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNX19Q92543 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX19Q92543 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX19Q92543 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNX19Q92543 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNX19Q92543 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNX19Q92543 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX19Q92543 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNX19Q92543 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNX19Q92543 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNX19Q92543 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNX19Q92543 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNX19Q92543 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNX19Q92543 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNX19Q92543 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNX19Q92543 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNX19Q92543 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNX19Q92543 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNX19Q92543 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNX19Q92543 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNX19Q92543 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNX19Q92543 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNX19Q92543 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNX19Q92543 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNX19Q92543 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNX19Q92543 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNX19Q92543 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNX19Q92543 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SNX19Q92543 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNX19Q92543 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNX19Q92543 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SNX19Q92543 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SNX19Q92543 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNX19Q92543 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNX19Q92543 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms