Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR60Q8WVS4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR60Q8WVS4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR60Q8WVS4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms