Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPBAR1Q8TDU6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPBAR1Q8TDU6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPBAR1Q8TDU6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPBAR1Q8TDU6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms