Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC148Q8NFR7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC148Q8NFR7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC148Q8NFR7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms