Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF548Q8NEK5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF548Q8NEK5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF548Q8NEK5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF548Q8NEK5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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