Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD1Q8NB12 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMYD1Q8NB12 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD1Q8NB12 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms