Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL2

SFTPA1, Pulmonary surfactant-associated protein A1, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA1Q8IWL2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPA1Q8IWL2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPA1Q8IWL2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPA1Q8IWL2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPA1Q8IWL2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFTPA1Q8IWL2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SFTPA1Q8IWL2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SFTPA1Q8IWL2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms