Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OTOP2Q7RTS6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
OTOP2Q7RTS6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
OTOP2Q7RTS6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms