Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMC5Q6UXY8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMC5Q6UXY8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms