Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TMC5Q6UXY8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TMC5Q6UXY8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TMC5Q6UXY8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TMC5Q6UXY8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TMC5Q6UXY8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TMC5Q6UXY8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TMC5Q6UXY8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
TMC5Q6UXY8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TMC5Q6UXY8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TMC5Q6UXY8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TMC5Q6UXY8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TMC5Q6UXY8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TMC5Q6UXY8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TMC5Q6UXY8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TMC5Q6UXY8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TMC5Q6UXY8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TMC5Q6UXY8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TMC5Q6UXY8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TMC5Q6UXY8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMC5Q6UXY8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMC5Q6UXY8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TMC5Q6UXY8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TMC5Q6UXY8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TMC5Q6UXY8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TMC5Q6UXY8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TMC5Q6UXY8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TMC5Q6UXY8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TMC5Q6UXY8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TMC5Q6UXY8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TMC5Q6UXY8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TMC5Q6UXY8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TMC5Q6UXY8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TMC5Q6UXY8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TMC5Q6UXY8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
TMC5Q6UXY8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TMC5Q6UXY8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TMC5Q6UXY8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TMC5Q6UXY8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TMC5Q6UXY8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TMC5Q6UXY8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMC5Q6UXY8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TMC5Q6UXY8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TMC5Q6UXY8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TMC5Q6UXY8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TMC5Q6UXY8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TMC5Q6UXY8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TMC5Q6UXY8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TMC5Q6UXY8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TMC5Q6UXY8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TMC5Q6UXY8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMC5Q6UXY8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMC5Q6UXY8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMC5Q6UXY8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMC5Q6UXY8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMC5Q6UXY8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMC5Q6UXY8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMC5Q6UXY8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TMC5Q6UXY8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TMC5Q6UXY8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMC5Q6UXY8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TMC5Q6UXY8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TMC5Q6UXY8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TMC5Q6UXY8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TMC5Q6UXY8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TMC5Q6UXY8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TMC5Q6UXY8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TMC5Q6UXY8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMC5Q6UXY8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMC5Q6UXY8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMC5Q6UXY8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMC5Q6UXY8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TMC5Q6UXY8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TMC5Q6UXY8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMC5Q6UXY8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMC5Q6UXY8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMC5Q6UXY8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMC5Q6UXY8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMC5Q6UXY8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMC5Q6UXY8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TMC5Q6UXY8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TMC5Q6UXY8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMC5Q6UXY8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMC5Q6UXY8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMC5Q6UXY8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMC5Q6UXY8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMC5Q6UXY8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMC5Q6UXY8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMC5Q6UXY8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMC5Q6UXY8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMC5Q6UXY8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMC5Q6UXY8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMC5Q6UXY8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMC5Q6UXY8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMC5Q6UXY8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TMC5Q6UXY8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMC5Q6UXY8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMC5Q6UXY8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMC5Q6UXY8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMC5Q6UXY8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms