Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CDC42EP5Q6NZY7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDC42EP5Q6NZY7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms