Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RHBDD2Q6NTF9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDD2Q6NTF9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDD2Q6NTF9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDD2Q6NTF9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDD2Q6NTF9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDD2Q6NTF9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDD2Q6NTF9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDD2Q6NTF9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDD2Q6NTF9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDD2Q6NTF9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDD2Q6NTF9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDD2Q6NTF9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDD2Q6NTF9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDD2Q6NTF9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDD2Q6NTF9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDD2Q6NTF9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDD2Q6NTF9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms