Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEE8

SLFN12L, Schlafen family member 12-like, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12LQ6IEE8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN12LQ6IEE8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN12LQ6IEE8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN12LQ6IEE8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN12LQ6IEE8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN12LQ6IEE8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN12LQ6IEE8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN12LQ6IEE8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLFN12LQ6IEE8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLFN12LQ6IEE8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms