Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLHDC7AQ5VTJ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC7AQ5VTJ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLHDC7AQ5VTJ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms