Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KLHDC7AQ5VTJ3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KLHDC7AQ5VTJ3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
KLHDC7AQ5VTJ3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
KLHDC7AQ5VTJ3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KLHDC7AQ5VTJ3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KLHDC7AQ5VTJ3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
KLHDC7AQ5VTJ3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KLHDC7AQ5VTJ3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
KLHDC7AQ5VTJ3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KLHDC7AQ5VTJ3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
KLHDC7AQ5VTJ3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KLHDC7AQ5VTJ3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KLHDC7AQ5VTJ3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KLHDC7AQ5VTJ3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
KLHDC7AQ5VTJ3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KLHDC7AQ5VTJ3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KLHDC7AQ5VTJ3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KLHDC7AQ5VTJ3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KLHDC7AQ5VTJ3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KLHDC7AQ5VTJ3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
KLHDC7AQ5VTJ3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KLHDC7AQ5VTJ3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KLHDC7AQ5VTJ3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KLHDC7AQ5VTJ3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KLHDC7AQ5VTJ3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
KLHDC7AQ5VTJ3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
KLHDC7AQ5VTJ3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KLHDC7AQ5VTJ3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KLHDC7AQ5VTJ3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KLHDC7AQ5VTJ3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KLHDC7AQ5VTJ3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KLHDC7AQ5VTJ3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KLHDC7AQ5VTJ3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KLHDC7AQ5VTJ3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KLHDC7AQ5VTJ3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KLHDC7AQ5VTJ3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KLHDC7AQ5VTJ3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KLHDC7AQ5VTJ3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KLHDC7AQ5VTJ3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KLHDC7AQ5VTJ3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KLHDC7AQ5VTJ3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KLHDC7AQ5VTJ3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
KLHDC7AQ5VTJ3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KLHDC7AQ5VTJ3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KLHDC7AQ5VTJ3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KLHDC7AQ5VTJ3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KLHDC7AQ5VTJ3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KLHDC7AQ5VTJ3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KLHDC7AQ5VTJ3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KLHDC7AQ5VTJ3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KLHDC7AQ5VTJ3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KLHDC7AQ5VTJ3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KLHDC7AQ5VTJ3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
KLHDC7AQ5VTJ3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
KLHDC7AQ5VTJ3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
KLHDC7AQ5VTJ3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KLHDC7AQ5VTJ3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KLHDC7AQ5VTJ3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KLHDC7AQ5VTJ3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KLHDC7AQ5VTJ3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KLHDC7AQ5VTJ3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KLHDC7AQ5VTJ3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KLHDC7AQ5VTJ3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
KLHDC7AQ5VTJ3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
KLHDC7AQ5VTJ3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KLHDC7AQ5VTJ3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KLHDC7AQ5VTJ3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KLHDC7AQ5VTJ3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
KLHDC7AQ5VTJ3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KLHDC7AQ5VTJ3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KLHDC7AQ5VTJ3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KLHDC7AQ5VTJ3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KLHDC7AQ5VTJ3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KLHDC7AQ5VTJ3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KLHDC7AQ5VTJ3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KLHDC7AQ5VTJ3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
KLHDC7AQ5VTJ3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KLHDC7AQ5VTJ3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
KLHDC7AQ5VTJ3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KLHDC7AQ5VTJ3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
KLHDC7AQ5VTJ3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KLHDC7AQ5VTJ3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KLHDC7AQ5VTJ3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KLHDC7AQ5VTJ3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KLHDC7AQ5VTJ3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
KLHDC7AQ5VTJ3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KLHDC7AQ5VTJ3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms