Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM61Q5EBN2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM61Q5EBN2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM61Q5EBN2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM61Q5EBN2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms