Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TAF1BQ53T94 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1BQ53T94 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1BQ53T94 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1BQ53T94 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms