Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL22Q53GT1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLHL22Q53GT1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL22Q53GT1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms