Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ODF3L2Q3SX64 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ODF3L2Q3SX64 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODF3L2Q3SX64 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms