Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP41Q3LFD5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP41Q3LFD5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP41Q3LFD5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP41Q3LFD5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms