Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPRNQ16849 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRNQ16849 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRNQ16849 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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