Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCOLCEQ15113 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCOLCEQ15113 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCOLCEQ15113 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCOLCEQ15113 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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