Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB39AQ14964 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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RAB39AQ14964 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB39AQ14964 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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RAB39AQ14964 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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RAB39AQ14964 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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