Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1DQ13901 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1DQ13901 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1DQ13901 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C1DQ13901 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1DQ13901 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1DQ13901 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1DQ13901 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1DQ13901 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1DQ13901 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1DQ13901 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1DQ13901 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1DQ13901 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1DQ13901 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1DQ13901 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1DQ13901 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1DQ13901 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1DQ13901 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1DQ13901 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1DQ13901 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1DQ13901 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1DQ13901 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1DQ13901 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1DQ13901 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1DQ13901 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1DQ13901 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1DQ13901 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C1DQ13901 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1DQ13901 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1DQ13901 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1DQ13901 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1DQ13901 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1DQ13901 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1DQ13901 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1DQ13901 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C1DQ13901 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1DQ13901 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1DQ13901 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1DQ13901 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1DQ13901 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C1DQ13901 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1DQ13901 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1DQ13901 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1DQ13901 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1DQ13901 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1DQ13901 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1DQ13901 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1DQ13901 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1DQ13901 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1DQ13901 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1DQ13901 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1DQ13901 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1DQ13901 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1DQ13901 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1DQ13901 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1DQ13901 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1DQ13901 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1DQ13901 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1DQ13901 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1DQ13901 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1DQ13901 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1DQ13901 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1DQ13901 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1DQ13901 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1DQ13901 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1DQ13901 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1DQ13901 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1DQ13901 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1DQ13901 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1DQ13901 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1DQ13901 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1DQ13901 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1DQ13901 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1DQ13901 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1DQ13901 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1DQ13901 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1DQ13901 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1DQ13901 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1DQ13901 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1DQ13901 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1DQ13901 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1DQ13901 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1DQ13901 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1DQ13901 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1DQ13901 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1DQ13901 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1DQ13901 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1DQ13901 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1DQ13901 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1DQ13901 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1DQ13901 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1DQ13901 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1DQ13901 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1DQ13901 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1DQ13901 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1DQ13901 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1DQ13901 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C1DQ13901 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1DQ13901 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1DQ13901 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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