Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NAE1Q13564 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
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