Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RPA4Q13156 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA4Q13156 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPA4Q13156 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA4Q13156 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms