Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CHRNDQ07001 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHRNDQ07001 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHRNDQ07001 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNDQ07001 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHRNDQ07001 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHRNDQ07001 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHRNDQ07001 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHRNDQ07001 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHRNDQ07001 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms