Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CLTCL1P53675 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CLTCL1P53675 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLTCL1P53675 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CLTCL1P53675 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms