Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KPNA1P52294 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KPNA1P52294 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA1P52294 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms