Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSC2P49815 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC2P49815 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC2P49815 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC2P49815 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC2P49815 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC2P49815 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC2P49815 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC2P49815 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC2P49815 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSC2P49815 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC2P49815 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC2P49815 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC2P49815 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC2P49815 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC2P49815 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC2P49815 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSC2P49815 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC2P49815 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC2P49815 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC2P49815 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC2P49815 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC2P49815 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC2P49815 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC2P49815 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC2P49815 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSC2P49815 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSC2P49815 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSC2P49815 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSC2P49815 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSC2P49815 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TSC2P49815 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSC2P49815 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TSC2P49815 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSC2P49815 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSC2P49815 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSC2P49815 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSC2P49815 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSC2P49815 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSC2P49815 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSC2P49815 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSC2P49815 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSC2P49815 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC2P49815 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC2P49815 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC2P49815 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC2P49815 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC2P49815 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC2P49815 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC2P49815 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC2P49815 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC2P49815 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC2P49815 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSC2P49815 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSC2P49815 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSC2P49815 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSC2P49815 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSC2P49815 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSC2P49815 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSC2P49815 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSC2P49815 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSC2P49815 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSC2P49815 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TSC2P49815 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSC2P49815 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TSC2P49815 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSC2P49815 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSC2P49815 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSC2P49815 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC2P49815 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC2P49815 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC2P49815 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC2P49815 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC2P49815 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSC2P49815 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSC2P49815 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSC2P49815 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSC2P49815 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSC2P49815 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC2P49815 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC2P49815 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC2P49815 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC2P49815 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC2P49815 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSC2P49815 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSC2P49815 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSC2P49815 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSC2P49815 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSC2P49815 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSC2P49815 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSC2P49815 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TSC2P49815 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSC2P49815 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TSC2P49815 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TSC2P49815 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSC2P49815 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSC2P49815 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSC2P49815 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TSC2P49815 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC2P49815 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms