Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLMP48507 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLMP48507 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLMP48507 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GCLMP48507 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCLMP48507 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCLMP48507 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCLMP48507 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCLMP48507 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GCLMP48507 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCLMP48507 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCLMP48507 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCLMP48507 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCLMP48507 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCLMP48507 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCLMP48507 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCLMP48507 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCLMP48507 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCLMP48507 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCLMP48507 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCLMP48507 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLMP48507 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLMP48507 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLMP48507 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLMP48507 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLMP48507 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLMP48507 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLMP48507 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLMP48507 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLMP48507 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLMP48507 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLMP48507 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCLMP48507 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLMP48507 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLMP48507 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLMP48507 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLMP48507 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLMP48507 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLMP48507 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLMP48507 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCLMP48507 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCLMP48507 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCLMP48507 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GCLMP48507 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GCLMP48507 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCLMP48507 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCLMP48507 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCLMP48507 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCLMP48507 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCLMP48507 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCLMP48507 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCLMP48507 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCLMP48507 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCLMP48507 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCLMP48507 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCLMP48507 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCLMP48507 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCLMP48507 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCLMP48507 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCLMP48507 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCLMP48507 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCLMP48507 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCLMP48507 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCLMP48507 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCLMP48507 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLMP48507 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLMP48507 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLMP48507 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLMP48507 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLMP48507 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLMP48507 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLMP48507 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLMP48507 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GCLMP48507 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCLMP48507 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCLMP48507 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GCLMP48507 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCLMP48507 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GCLMP48507 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCLMP48507 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCLMP48507 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCLMP48507 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCLMP48507 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCLMP48507 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCLMP48507 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCLMP48507 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCLMP48507 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCLMP48507 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCLMP48507 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCLMP48507 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCLMP48507 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCLMP48507 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCLMP48507 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCLMP48507 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GCLMP48507 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCLMP48507 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCLMP48507 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCLMP48507 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GCLMP48507 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCLMP48507 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms