Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ACADSBP45954 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACADSBP45954 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACADSBP45954 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACADSBP45954 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACADSBP45954 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms