Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA4P43694 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA4P43694 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATA4P43694 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATA4P43694 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATA4P43694 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATA4P43694 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATA4P43694 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA4P43694 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA4P43694 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA4P43694 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA4P43694 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA4P43694 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA4P43694 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA4P43694 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA4P43694 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA4P43694 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA4P43694 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA4P43694 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA4P43694 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA4P43694 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA4P43694 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATA4P43694 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATA4P43694 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATA4P43694 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATA4P43694 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATA4P43694 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATA4P43694 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATA4P43694 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATA4P43694 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATA4P43694 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATA4P43694 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATA4P43694 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATA4P43694 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATA4P43694 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATA4P43694 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATA4P43694 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATA4P43694 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATA4P43694 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATA4P43694 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATA4P43694 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATA4P43694 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GATA4P43694 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATA4P43694 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATA4P43694 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATA4P43694 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATA4P43694 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATA4P43694 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GATA4P43694 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATA4P43694 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATA4P43694 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATA4P43694 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATA4P43694 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATA4P43694 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GATA4P43694 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GATA4P43694 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATA4P43694 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATA4P43694 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATA4P43694 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATA4P43694 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATA4P43694 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATA4P43694 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATA4P43694 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATA4P43694 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATA4P43694 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATA4P43694 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATA4P43694 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATA4P43694 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATA4P43694 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATA4P43694 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATA4P43694 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATA4P43694 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATA4P43694 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATA4P43694 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATA4P43694 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATA4P43694 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATA4P43694 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GATA4P43694 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GATA4P43694 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATA4P43694 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATA4P43694 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATA4P43694 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATA4P43694 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA4P43694 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA4P43694 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATA4P43694 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA4P43694 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA4P43694 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA4P43694 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATA4P43694 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA4P43694 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA4P43694 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA4P43694 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA4P43694 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATA4P43694 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA4P43694 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA4P43694 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA4P43694 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA4P43694 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATA4P43694 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms