Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS4P35443 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS4P35443 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS4P35443 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS4P35443 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS4P35443 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS4P35443 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS4P35443 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS4P35443 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THBS4P35443 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS4P35443 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS4P35443 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS4P35443 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS4P35443 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS4P35443 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THBS4P35443 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS4P35443 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS4P35443 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS4P35443 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
THBS4P35443 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS4P35443 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS4P35443 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS4P35443 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS4P35443 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS4P35443 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS4P35443 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS4P35443 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS4P35443 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS4P35443 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THBS4P35443 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS4P35443 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS4P35443 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS4P35443 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS4P35443 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS4P35443 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS4P35443 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS4P35443 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THBS4P35443 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THBS4P35443 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
THBS4P35443 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THBS4P35443 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THBS4P35443 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THBS4P35443 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THBS4P35443 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THBS4P35443 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THBS4P35443 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THBS4P35443 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
THBS4P35443 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.29■■□□□ 1
THBS4P35443 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
THBS4P35443 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THBS4P35443 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THBS4P35443 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
THBS4P35443 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THBS4P35443 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THBS4P35443 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THBS4P35443 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THBS4P35443 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THBS4P35443 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
THBS4P35443 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THBS4P35443 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
THBS4P35443 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
THBS4P35443 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.27■■□□□ 1
THBS4P35443 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
THBS4P35443 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS4P35443 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS4P35443 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS4P35443 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
THBS4P35443 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THBS4P35443 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THBS4P35443 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THBS4P35443 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
THBS4P35443 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS4P35443 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS4P35443 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS4P35443 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS4P35443 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS4P35443 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS4P35443 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
THBS4P35443 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THBS4P35443 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THBS4P35443 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THBS4P35443 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
THBS4P35443 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
THBS4P35443 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS4P35443 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS4P35443 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS4P35443 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS4P35443 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS4P35443 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS4P35443 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS4P35443 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
THBS4P35443 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS4P35443 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS4P35443 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS4P35443 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS4P35443 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS4P35443 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS4P35443 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS4P35443 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
THBS4P35443 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms