Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRR1AP35321 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRR1AP35321 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRR1AP35321 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRR1AP35321 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRR1AP35321 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRR1AP35321 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRR1AP35321 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRR1AP35321 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRR1AP35321 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPRR1AP35321 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1AP35321 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1AP35321 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1AP35321 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1AP35321 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1AP35321 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1AP35321 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1AP35321 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1AP35321 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1AP35321 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1AP35321 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1AP35321 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1AP35321 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1AP35321 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1AP35321 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPRR1AP35321 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPRR1AP35321 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPRR1AP35321 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPRR1AP35321 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms