Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HLA-FP30511 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-FP30511 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-FP30511 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-FP30511 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms