Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
COL4A5P29400 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
COL4A5P29400 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
COL4A5P29400 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL4A5P29400 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL4A5P29400 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
COL4A5P29400 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
COL4A5P29400 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
COL4A5P29400 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
COL4A5P29400 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
COL4A5P29400 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
COL4A5P29400 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms