Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PTPRDP23468 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRDP23468 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRDP23468 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRDP23468 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
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