Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATF3P18847 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATF3P18847 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATF3P18847 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATF3P18847 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATF3P18847 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATF3P18847 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATF3P18847 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATF3P18847 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATF3P18847 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATF3P18847 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATF3P18847 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATF3P18847 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATF3P18847 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATF3P18847 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATF3P18847 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATF3P18847 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATF3P18847 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATF3P18847 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ATF3P18847 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ATF3P18847 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ATF3P18847 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATF3P18847 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATF3P18847 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATF3P18847 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATF3P18847 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATF3P18847 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ATF3P18847 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ATF3P18847 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ATF3P18847 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATF3P18847 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATF3P18847 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATF3P18847 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ATF3P18847 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ATF3P18847 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATF3P18847 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATF3P18847 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATF3P18847 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATF3P18847 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ATF3P18847 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATF3P18847 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATF3P18847 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATF3P18847 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATF3P18847 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATF3P18847 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATF3P18847 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATF3P18847 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATF3P18847 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATF3P18847 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATF3P18847 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATF3P18847 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATF3P18847 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ATF3P18847 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATF3P18847 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATF3P18847 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ATF3P18847 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ATF3P18847 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATF3P18847 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ATF3P18847 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATF3P18847 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATF3P18847 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATF3P18847 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATF3P18847 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATF3P18847 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATF3P18847 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATF3P18847 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATF3P18847 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATF3P18847 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATF3P18847 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATF3P18847 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATF3P18847 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATF3P18847 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATF3P18847 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATF3P18847 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATF3P18847 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATF3P18847 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATF3P18847 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ATF3P18847 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATF3P18847 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATF3P18847 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATF3P18847 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATF3P18847 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ATF3P18847 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATF3P18847 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATF3P18847 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATF3P18847 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATF3P18847 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATF3P18847 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATF3P18847 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATF3P18847 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATF3P18847 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATF3P18847 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATF3P18847 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ATF3P18847 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATF3P18847 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATF3P18847 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATF3P18847 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATF3P18847 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATF3P18847 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATF3P18847 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms