Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EGR1P18146 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
EGR1P18146 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EGR1P18146 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EGR1P18146 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EGR1P18146 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EGR1P18146 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR1P18146 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR1P18146 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR1P18146 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR1P18146 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR1P18146 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR1P18146 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EGR1P18146 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR1P18146 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR1P18146 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR1P18146 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR1P18146 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR1P18146 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EGR1P18146 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR1P18146 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR1P18146 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR1P18146 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR1P18146 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR1P18146 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR1P18146 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR1P18146 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR1P18146 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EGR1P18146 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EGR1P18146 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR1P18146 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR1P18146 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR1P18146 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR1P18146 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR1P18146 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR1P18146 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EGR1P18146 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR1P18146 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR1P18146 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR1P18146 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR1P18146 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR1P18146 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR1P18146 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR1P18146 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR1P18146 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR1P18146 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR1P18146 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR1P18146 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR1P18146 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR1P18146 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EGR1P18146 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR1P18146 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR1P18146 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR1P18146 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR1P18146 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR1P18146 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR1P18146 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR1P18146 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR1P18146 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR1P18146 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR1P18146 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR1P18146 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR1P18146 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR1P18146 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR1P18146 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR1P18146 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR1P18146 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR1P18146 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR1P18146 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR1P18146 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR1P18146 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR1P18146 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR1P18146 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR1P18146 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR1P18146 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR1P18146 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR1P18146 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR1P18146 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR1P18146 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR1P18146 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR1P18146 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR1P18146 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EGR1P18146 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR1P18146 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR1P18146 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR1P18146 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR1P18146 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR1P18146 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR1P18146 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR1P18146 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR1P18146 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR1P18146 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR1P18146 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR1P18146 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR1P18146 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR1P18146 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR1P18146 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR1P18146 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR1P18146 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR1P18146 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms