Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFRAP16234 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFRAP16234 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDGFRAP16234 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFRAP16234 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms