Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRAFP15056 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRAFP15056 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRAFP15056 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRAFP15056 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRAFP15056 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRAFP15056 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRAFP15056 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRAFP15056 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRAFP15056 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRAFP15056 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRAFP15056 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRAFP15056 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRAFP15056 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRAFP15056 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRAFP15056 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRAFP15056 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRAFP15056 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRAFP15056 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRAFP15056 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRAFP15056 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRAFP15056 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRAFP15056 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRAFP15056 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRAFP15056 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRAFP15056 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRAFP15056 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRAFP15056 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRAFP15056 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRAFP15056 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BRAFP15056 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRAFP15056 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRAFP15056 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAFP15056 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAFP15056 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAFP15056 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAFP15056 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAFP15056 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAFP15056 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAFP15056 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAFP15056 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAFP15056 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAFP15056 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAFP15056 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAFP15056 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAFP15056 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAFP15056 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAFP15056 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAFP15056 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAFP15056 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAFP15056 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAFP15056 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAFP15056 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAFP15056 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAFP15056 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAFP15056 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAFP15056 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAFP15056 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAFP15056 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAFP15056 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAFP15056 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAFP15056 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAFP15056 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAFP15056 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAFP15056 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAFP15056 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAFP15056 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAFP15056 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAFP15056 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAFP15056 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAFP15056 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAFP15056 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAFP15056 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAFP15056 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAFP15056 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAFP15056 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAFP15056 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAFP15056 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRAFP15056 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRAFP15056 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRAFP15056 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAFP15056 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAFP15056 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAFP15056 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAFP15056 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAFP15056 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAFP15056 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAFP15056 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAFP15056 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAFP15056 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRAFP15056 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRAFP15056 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRAFP15056 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRAFP15056 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRAFP15056 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAFP15056 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAFP15056 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAFP15056 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAFP15056 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAFP15056 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms