Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
CFTRP13569 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
CFTRP13569 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC42.88■■■■■ 4.46
CFTRP13569 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
CFTRP13569 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
CFTRP13569 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CFTRP13569 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CFTRP13569 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CFTRP13569 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CFTRP13569 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CFTRP13569 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
CFTRP13569 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
CFTRP13569 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
CFTRP13569 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
CFTRP13569 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
CFTRP13569 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CFTRP13569 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CFTRP13569 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CFTRP13569 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
CFTRP13569 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CFTRP13569 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CFTRP13569 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CFTRP13569 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CFTRP13569 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CFTRP13569 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CFTRP13569 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CFTRP13569 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CFTRP13569 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CFTRP13569 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CFTRP13569 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CFTRP13569 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CFTRP13569 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
CFTRP13569 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CFTRP13569 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CFTRP13569 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CFTRP13569 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CFTRP13569 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
CFTRP13569 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CFTRP13569 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CFTRP13569 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.43
CFTRP13569 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
CFTRP13569 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CFTRP13569 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CFTRP13569 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CFTRP13569 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC42.73■■■■■ 4.43
CFTRP13569 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
CFTRP13569 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
CFTRP13569 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CFTRP13569 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CFTRP13569 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CFTRP13569 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CFTRP13569 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
CFTRP13569 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CFTRP13569 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.43
CFTRP13569 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CFTRP13569 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
CFTRP13569 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CFTRP13569 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
CFTRP13569 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
CFTRP13569 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CFTRP13569 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CFTRP13569 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CFTRP13569 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CFTRP13569 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CFTRP13569 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
CFTRP13569 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CFTRP13569 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
CFTRP13569 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CFTRP13569 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CFTRP13569 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CFTRP13569 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CFTRP13569 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CFTRP13569 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CFTRP13569 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CFTRP13569 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CFTRP13569 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CFTRP13569 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CFTRP13569 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CFTRP13569 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CFTRP13569 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CFTRP13569 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
CFTRP13569 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
CFTRP13569 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CFTRP13569 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
CFTRP13569 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
CFTRP13569 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CFTRP13569 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CFTRP13569 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CFTRP13569 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CFTRP13569 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CFTRP13569 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CFTRP13569 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
CFTRP13569 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CFTRP13569 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CFTRP13569 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CFTRP13569 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CFTRP13569 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CFTRP13569 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CFTRP13569 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
CFTRP13569 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms