Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRFP11831 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRFP11831 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SRFP11831 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRFP11831 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRFP11831 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRFP11831 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRFP11831 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRFP11831 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SRFP11831 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRFP11831 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRFP11831 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRFP11831 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRFP11831 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRFP11831 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SRFP11831 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRFP11831 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRFP11831 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRFP11831 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRFP11831 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRFP11831 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRFP11831 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SRFP11831 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRFP11831 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRFP11831 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRFP11831 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRFP11831 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRFP11831 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRFP11831 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRFP11831 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRFP11831 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRFP11831 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRFP11831 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRFP11831 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRFP11831 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRFP11831 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRFP11831 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRFP11831 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRFP11831 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRFP11831 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRFP11831 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRFP11831 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRFP11831 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRFP11831 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRFP11831 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRFP11831 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRFP11831 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRFP11831 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRFP11831 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRFP11831 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRFP11831 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRFP11831 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRFP11831 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRFP11831 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRFP11831 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRFP11831 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRFP11831 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRFP11831 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRFP11831 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRFP11831 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRFP11831 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRFP11831 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRFP11831 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRFP11831 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRFP11831 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRFP11831 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRFP11831 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRFP11831 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRFP11831 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRFP11831 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRFP11831 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRFP11831 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SRFP11831 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRFP11831 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRFP11831 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRFP11831 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRFP11831 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SRFP11831 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRFP11831 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRFP11831 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SRFP11831 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRFP11831 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRFP11831 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRFP11831 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRFP11831 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRFP11831 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRFP11831 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRFP11831 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRFP11831 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRFP11831 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRFP11831 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRFP11831 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRFP11831 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRFP11831 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRFP11831 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRFP11831 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRFP11831 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRFP11831 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRFP11831 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRFP11831 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms