Protein–RNA interactions for Protein: P11717

IGF2R, Cation-independent mannose-6-phosphate receptor, humanhuman

Predictions only

Length 2,491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2RP11717 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGF2RP11717 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGF2RP11717 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGF2RP11717 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGF2RP11717 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGF2RP11717 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGF2RP11717 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGF2RP11717 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGF2RP11717 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
IGF2RP11717 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGF2RP11717 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGF2RP11717 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms