Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD28P10747 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD28P10747 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD28P10747 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD28P10747 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CD28P10747 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD28P10747 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD28P10747 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD28P10747 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD28P10747 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD28P10747 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD28P10747 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD28P10747 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD28P10747 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD28P10747 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD28P10747 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD28P10747 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD28P10747 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD28P10747 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD28P10747 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD28P10747 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD28P10747 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD28P10747 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CD28P10747 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD28P10747 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD28P10747 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD28P10747 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD28P10747 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD28P10747 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD28P10747 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD28P10747 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CD28P10747 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD28P10747 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD28P10747 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD28P10747 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD28P10747 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD28P10747 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD28P10747 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CD28P10747 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD28P10747 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD28P10747 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD28P10747 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD28P10747 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CD28P10747 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD28P10747 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD28P10747 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD28P10747 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD28P10747 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD28P10747 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD28P10747 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CD28P10747 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CD28P10747 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CD28P10747 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD28P10747 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD28P10747 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD28P10747 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD28P10747 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD28P10747 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD28P10747 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD28P10747 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD28P10747 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CD28P10747 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD28P10747 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD28P10747 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD28P10747 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD28P10747 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD28P10747 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD28P10747 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD28P10747 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD28P10747 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD28P10747 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD28P10747 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD28P10747 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD28P10747 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD28P10747 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD28P10747 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD28P10747 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CD28P10747 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD28P10747 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD28P10747 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD28P10747 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD28P10747 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD28P10747 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD28P10747 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD28P10747 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD28P10747 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD28P10747 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD28P10747 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD28P10747 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD28P10747 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD28P10747 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD28P10747 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD28P10747 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD28P10747 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD28P10747 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD28P10747 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD28P10747 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD28P10747 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CD28P10747 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD28P10747 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms